科普特东正教教会是早期四大教区之一:耶路撒冷,安提阿,亚历山大(埃及)和罗马。科普特教会是非洲首一个教会。
科普特教会由耶稣门徒圣马可建立的。圣马可是《马可福音》的作者,他大约公元48年来到埃及传扬福音。
根据记载,因圣马可而成为埃及的第一个信徒是一名鞋匠安尼阿那斯(Anianus)。之后,安尼阿那斯(Anianus)和他的全家人都受洗,而福音也开始蔓延至他的朋友和邻居。在圣会后,圣徒马可任命了一位主教(安尼阿那斯Anianus,后来成为他的继任者)、三位神父和七个执事管理教会。公元68年圣马可在亚历山大城殉道。
科普特教会的第一任宗主教(又叫教宗)就是创始人圣马可。从使徒时代起至现今,教宗体系没有间断地一直继承了下来,我们现任的教宗就是Tawadros II,继圣马可之后的第118位教宗。
亚历山大这座国际性大都市在当时被视为教育之都。埃及、希腊以及犹太文化的汇集使它成为了得天独厚的文化中心。在这种环境下,在亚历山大成立教理学院势在必行。
依据圣杰罗姆曾的记录,亚历山大学院由圣马可亲自创立。他受到圣灵的启示:建立教理学院及教授基督教理是使基督教在亚历山大稳固的唯一之路。